Полимеразы определяют начало работы (инициацию) по промотору — определённой последовательности нуклеотидов РНК или ДНК, которая указывает на начало транскрипции конкретного гена или цепочки генов. 13

Например, у некоторых бактерий (прокариотов) это -10 и -35 элементы — последовательности длиной по 6 нуклеотидов, расположенные выше сайта начала транскрипции и разделённые 17 нуклеотидами. 1 Эти элементы распознаёт σ-фактор, субъединица бактериальных полимераз. 1

У эукариотов схема немного другая: например, TATA-Box между -31 и -26, BRE-элемент, находящийся между -37 и -32, DPE-элемент между +28 и +32 и другие. 1

После определения промотора полимераза соединяется с матрицей и запускает транскрипцию. 1