Методы гидролиза и секвенирования помогли расшифровать структуру белков следующим образом:

1. Гидролиз позволяет установить аминокислотный состав белков. 1 Полный гидролиз до отдельных аминокислот осуществляется действием сильных кислот или сильных оснований, а неполный, в том числе селективный (по отдельным пептидным связям) — под действием протеолитических ферментов или на ионообменных смолах. 1 В результате такой обработки разрушаются пептидные связи в белке, а в гидролизате присутствуют только свободные аминокислоты. 2
2. Секвенирование помогает определить аминокислотную последовательность всего белка или пептида или его части. 3 Это может служить для идентификации белка или характеристики его посттрансляционных модификаций. 3 Как правило, частичное секвенирование белка предоставляет достаточную информацию для его идентификации со ссылкой на базы данных белковых последовательностей. 3 Многократное повторение ступенчатой деградации даёт возможность последовательно идентифицировать все составляющие исходный полипептид остатки аминокислот, то есть установить его первичную структуру. 5