Роль пресмыкающихся в экосистеме Земли менялась со временем. 5

В мезозойскую эру рептилии господствовали на суше, занимали все природные среды и использовали все возможные пищевые стратегии. 5 Расцвет пресмыкающихся был возможен благодаря тёплому и мягкому климату мезозоя. 5

К концу мезозойской эры, когда температура понизилась, а климат стал более континентальным, гигантские рептилии потеряли жизнеспособность, а более мелкие — активность и подвижность ночью и в зимний период. 5 В борьбе за существование они проиграли животным, которые не зависели от температурных условий внешней среды: птицам и млекопитающим. 5

В настоящее время пресмыкающиеся играют важную роль в экосистеме, выступая звеном пищевых цепочек разнообразных биогеоценозов. 3 Например, многие позвоночные животные, в том числе хищные птицы, питаются пресмыкающимися. 3 Также крокодилы и змеи выступают санитарами наземных и водных биогеоценозов, уничтожая преимущественно больных и ослабленных животных. 3