Гидрофобные взаимодействия влияют на формирование биологических структур следующим образом:

• В белках при укладке полипептидной цепи в глобулярную третичную структуру важную роль играют взаимодействия боковых радикалов с водой. 2 Гидрофильные остатки гидратируются и имеют тенденцию остаться на поверхности глобулы, а гидрофобные не связывают молекулы воды и поэтому образуют внутреннее ядро глобулы. 2 В результате образуется глобула с гидрофобным ядром и гидрофильной поверхностью. 1
• Под влиянием гидрофобных взаимодействий происходит формирование структуры двойной спирали ДНК. 2 Спираль закручена таким образом, что гидрофобные остатки азотистых оснований оказываются внутри спирали, где их контакт с водой ограничен, а гидрофильный сахаро-фосфатный остов оказывается на поверхности. 2
• Гидрофобные взаимодействия определяют структуру биомембран. 2 Гидрофильные части липидных молекул находятся на поверхности мембраны, а их гидрофобные «хвосты» образуют внутреннюю область. 2