Микрококки в природе распространены повсеместно и могут быть обнаружены в следующих местах: в почве, воздухе, пресных и солёных водоёмах, а также в пищевых продуктах. 12
Кроме того, микрококки встречаются на поверхности растений и на коже человека и животных. 5