Некоторые другие отличия Y-хромосом от X-хромосом:

• Длина. 1 X-хромосома имеет длину около 155 миллионов пар нуклеотидов и состоит из 800–900 кодирующих генов, а Y-хромосома — 59 миллионов пар нуклеотидов и 50–60 генов. 1
• Количество генов. 2 Х-хромосома содержит более 1000 рабочих генов, а Y-хромосома — менее 100 рабочих генов. 2 При этом функции значительной части генов Y-хромосомы обусловливают развитие гонад и половой системы. 4