Паранаучная диагностика отличается от научной тем, что она основана на гипотетических, псевдонаучных концепциях, в которых связь между диагностическими признаками и категориями постулируется, но не доказывается. 2
Научная диагностика, в свою очередь, следует особому, научно обоснованному технологическому алгоритму, который известен другим специалистам. 1 Все ключи к научным методикам проверяются экспериментально. 1
Кроме того, паранаучная диагностика часто объявляет некоторые гипотетические и сомнительные связи «познанными» и «доказанными», в то время как серьёзных научных доказательств их истинности нет. 1
Таким образом, научная диагностика опирается на проверенные методы и алгоритмы, в то время как паранаучная диагностика использует недоказанные концепции и методы, которые не имеют научного обоснования.