Чем отличаются болгарские перцы от сладких перцев в ботаническом смысле?

Возможно, имелись в виду различия между болгарским и сладким перцем с точки зрения ботаники.

Болгарский перец в кулинарии считается овощем, но с ботанической точки зрения это фрукт, классифицируемый как ягода. school-science.ru en.wikipedia.org

Сладкий перец — это разновидность стручкового перца, его отличительная черта — минимальная острота и сладкий вкус. www.gastronom.ru

Таким образом, основное отличие в том, что с точки зрения ботаники болгарский перец — это фрукт, а сладкий перец — разновидность стручкового перца.