Штамм микроорганизма и его вид отличаются по своему определению и характеристикам. 24

Штамм — это чистая культура микроорганизмов одного вида, выделенная из определённого источника или полученная в результате мутаций. 6 Разные штаммы одного и того же микроорганизма могут различаться по ряду свойств (чувствительность к антибиотикам, вирулентность, способность синтезировать те или иные биологически активные соединения и т. д.). 6

Вид — это эволюционно сложившаяся совокупность особей, имеющая единый генотип, который в стандартных условиях проявляется сходными морфологическими, физиологическими, биохимическими и другими признаками. 5

Таким образом, штамм — более узкое понятие, чем вид, так как представляет конкретный образец (изолят) данного вида, в то время как вид — это общая таксономическая единица, совокупность микроорганизмов с общими характеристиками. 210