Плавательный пузырь у двоякодышащих и лучепёрых рыб отличается по строению и функциям:

• У двоякодышащих рыб плавательный пузырь превращён в одно или два «лёгких» и приспособлен для дыхания атмосферным воздухом. 3 В нём сохраняется проглоченный увлажнённый воздух. 2
• У лучепёрых рыб плавательный пузырь выполняет гидростатическую функцию — обеспечивает плавучесть. 24 Изменяя объём пузыря, рыба регулирует среднюю плотность тела. 2

Таким образом, у двоякодышащих рыб плавательный пузырь выполняет ещё и дыхательную функцию, в то время как у лучепёрых рыб он служит только для поддержания плавучести.