Большой суслик опасен для сельского хозяйства по нескольким причинам:

• Повреждение посевов. 2 Суслики значительно разрежают посевы, а местами полностью уничтожают их, выкапывая заделанные семена и поедая всходы. 2 Особенно большой вред наносят зерновым культурам, поедая зелёные растения и зёрна в колосе. 3
• Вред многолетним травам. 3 Кроме поедания зелёной массы, суслики наносят вред, выкапывая норы и выбрасывая много земли на поверхность, что затрудняет уборку трав. 3
• Ухудшение состава кормовых растений. 2 На пастбищах суслики ухудшают видовой состав кормовых растений, поедая наиболее ценные из них. 2
• Вред полезащитным лесным насаждениям. 2 Суслики вредят, выкапывая желуди, особенно посадкам дуба. 2
• Изменение химического состава почвы. 2 Активная роющая деятельность сусликов приводит к изменению химического состава почвы и её засолению. 2

Кроме того, суслики опасны тем, что являются переносчиками чумы и других инфекционных болезней. 3 Заражение происходит через блох или при непосредственном соприкосновении с больными особями. 3