Есть ли какие-то различия между варганом и кубызом или это одно и то же?

Варган и кубыз — это один и тот же инструмент. yandex.ru Просто разные названия употребляются в различных районах Башкирии и Татарстана. yandex.ru

Однако некоторые различия между этими инструментами всё же есть:

• Кубыз — название башкирского варгана. ru.wikipedia.org В Башкирии известен деревянный пластинчатый агас-кумыз и металлический тимер-кумыз. ru.wikipedia.org
• В отличие от алтайских и якутских варганов, башкирские кубызы обладают более певучим звуком, вплоть до звона у высоко настроенных инструментов. www.ta-musica.ru

Таким образом, кубыз — это конкретная разновидность варгана, отличающаяся некоторыми особенностями звучания. ru.wikipedia.org www.ta-musica.ru