Паноптикум и музей редкостей — это разные понятия, каждое из которых имеет своё значение.

Паноптикум — это музей или коллекция разнообразных редкостей, причудливых существ, восковых фигур. 23 В переносном смысле — сборище чего-то невероятного, жуткого. 510

Музей редкостей — это комната для размещения и хранения тематических коллекций, состоящих из естественно-научных экспонатов или разнообразных древних, редких и курьёзных вещей, как природных, так и рукотворных. 4

Таким образом, основное отличие в том, что паноптикум фокусируется на необычных и уникальных предметах, а музей редкостей — на тематических коллекциях редкостей и курьёзных вещей.