Некоторые ключевые отличия игровой механики Undertale от традиционных ролевых игр:

• Возможность мирного разрешения конфликтов. 1 Игрок может проходить игру без убийства противников, выстраивая с ними дружеские отношения. 1 Для этого необходимо подобрать правильные действия, соответствующие характеру конкретного монстра. 1
• Система сохранений. 1 Специальные точки не только записывают прогресс игрока, но и восстанавливают здоровье персонажа. 1
• Боевая система в стиле Bullet Hell. 14 Во время битвы игрок управляет сердцем — символом души героя — и должен избегать атак противника. 14 При этом сражения можно избежать: всегда есть выбор — вступить в диалог с противником, использовать особые предметы или просто убежать. 1
• Разветвления сюжета и различные концовки. 4 Их получение зависит от того, как игрок взаимодействует с встреченными монстрами — убивает их или щадит. 14 Дополнительно существуют специальные варианты завершения истории, открывающиеся при выполнении определённых условий. 1
• Адаптация игрового процесса под способности игрока. 3 Игра «запоминает» действия игрока и частично адаптирует игровой процесс под его способности. 3