Некоторые отличия Red Alert 3 от предыдущих частей серии:

• Третья сторона конфликта. 24 К традиционным США и СССР добавилась Япония, которая теперь претендует на звание сверхдержавы наравне с США и СССР. 2
• Кооперативный режим. 13 Игрок может работать в команде как с внутриигровым ИИ, так и с другим игроком. 1
• Отказ от принципа «раш». 1 В отличие от предыдущих игр серии, нельзя победить, построив большое количество однотипных сильных юнитов, и здесь необходима комбинация разных войск. 1
• Увеличенная роль морских сражений. 14 Военная база игрока практически полностью может быть сооружена на воде, за исключением лишь казармы и военного завода. 1