Minecraft Education Edition отличается от обычной версии игры рядом особенностей, направленных на образовательные цели: 24

• Встроенный «режим класса». 5 С его помощью учителя могут взаимодействовать с учениками, управлять настройками мира, следить за выполнением задания. 5
• Планы уроков. 14 На сайте игры доступны специально составленные уроки в разных областях: литература, наука, история и культура, информационные технологии, математика, искусство и дизайн. 1
• Виртуальные аудитории. 1 Они позволяют ученику «пережить» происходящие события или поучаствовать в интерактивном уроке. 1
• Дополнительные предметы. 2 В образовательную версию игры добавлены, например, фотоаппарат, портфель и классная доска разных форм и размеров. 2
• Ограничения. 2 Преподаватели могут устанавливать, что могут и чего не могут делать ученики в игре. 2 В обычной версии Minecraft практически нет ограничений. 2