Разница между территориальной и регистрирующей налоговыми инспекциями заключается в их функциях:

1. Территориальная инспекция взаимодействует с уже действующими предприятиями. 1 Она контролирует платежи, налоговые поступления и проводит проверки. 1 Также территориальные инспекции рассматривают обращения от местных предприятий и налогоплательщиков. 1
2. Регистрирующая инспекция ставит на налоговый учёт вновь созданный бизнес и присваивает ему ИНН. 1 Кроме того, регистрирующая инспекция выдаёт свидетельства о государственной регистрации, выдаёт и меняет ОГРН, принимает документы для регистрации физических лиц в качестве индивидуальных предпринимателей. 1

Таким образом, задача территориальной инспекции — контроль за уже существующим бизнесом, а регистрирующей — оформление новых предпринимателей и компаний. 2 Также они принимают обращения для изменения данных о действующем бизнесе в госреестрах, здесь же проходит ликвидация бизнеса. 2