Разница между таможенной и регистрационной пошлинами заключается в сферах, за которые взимаются платежи, и в их функциях.

Таможенная пошлина — это обязательный платёж, который взимают таможенные органы в связи с перемещением товаров через таможенную границу. 25 Уплата таможенной пошлины является условием ввоза или вывоза товара и обеспечивается мерами государственного принуждения. 5

Регистрационная пошлина (госпошлина) — это сбор, который необходимо уплатить в бюджет за выполнение определённых юридически значимых действий или предоставление госуслуг. 7 В их число входит регистрация права собственности на недвижимое имущество — квартиры, дома, комнаты, земельные участки, коммерческую недвижимость. 7

Таким образом, таможенная пошлина связана с внешнеэкономической деятельностью и таможенными операциями, а регистрационная пошлина — с регистрацией определённых юридических действий и правами на имущество.