В чем разница между недоплаченной зарплатой и не доплаченной зарплатой?

Возможно, имелись в виду понятия «недоплаченная зарплата» и «невыплаченная зарплата».

Недоплаченная зарплата возникает из-за ошибки при расчёте заработной платы, когда работодатель не выплатил всю сумму. skynum.com megaconsult.ru Это может быть, например, когда не прошло начисление индексации или неправильно рассчитали количество отработанных часов. skynum.com

Невыплаченная зарплата — более широкое понятие, которое может включать случаи, когда работодатель не выплачивает зарплату вообще или делает это не в полном объёме. www.garant.ru pravo.legal

Таким образом, разница между этими понятиями в том, что первое связано с ошибкой в расчёте, а второе — с нарушением сроков выплаты или оплаты всей суммы.