Несколько возможных причин, по которым корректировочный счёт-фактура не попадает в книгу продаж в 1С:

• Ошибка в настройках периода формирования. 13 В настройках книги продаж нужно указать, за какой период формировать дополнительные листы. 1
• Не проведена обработка по регистрам НДС. 34 Движения по регистру «НДС начисленный» появляются только после проведения по регистрам НДС. 3
• Документ «Корректировка реализации» создан в прошлом году, а счёт-фактура к нему формируется в текущем. 2 В таком случае счёт-фактура не может быть выставлен текущим годом, так как его нужно было выставить в течение 5 дней с даты корректировки реализации. 2

Если самостоятельно решить проблему не удаётся, рекомендуется обратиться к специалисту.