В чем разница между регистрацией и учетом документов?

Возможно, имелись в виду различия между понятиями «регистрация» и «учёт» документов.

Регистрация — это запись учётных данных о документе по установленной форме, которая фиксирует факт его создания, отправления или получения. spravochnick.ru Регистрация позволяет создать базу данных о документах учреждения, а также обеспечивает юридическую силу документу, так как подтверждает факт его создания или получения. spravochnick.ru delo-press.ru

Учёт документов, в свою очередь, даёт количественные данные для обсчёта общего объёма документооборота и его анализа за определённый промежуток времени, по видам документов, по документопотокам, по структурным подразделениям и т. п.. spravochnick.ru

Таким образом, разница между регистрацией и учётом документов заключается в том, что регистрация фокусируется на фиксации факта существования документа, а учёт — на количественных показателях документооборота и его анализе.