Некоторые отличия классических греческих рецептов мусаки от балканских:

• В греческих рецептах используется рубленое мясо, для приготовления обычно берут баранину или говядину. 7 Также в блюде присутствует белое сухое вино, в котором тушится фарш, и соус бешамель. 17
• В балканских рецептах баклажаны часто полностью заменяют томатами, а мясо мелко нарезается. 4 Кроме того, в такую мусаку могут добавлять другие овощи, например, кабачки, картофель, капусту или сметану, а также использовать разные виды мяса. 79

Ещё одно отличие заключается в том, что в греческих рецептах все ингредиенты закладываются в форму слоями, а в балканских — мясо обжаривается на сковороде с луком, чесноком и специями, а затем соусом из томатов или томатной пастой, после чего добавляется слой нарезанных картофеля и баклажанов. 210