Чем крупеник отличается от обычной запеканки из творога и гречки?

Возможно, имелись в виду различия между крупеником и запеканкой в целом.

Крупеник — это запеканка из крупы, чаще всего гречневой, пшеничной или манной. www.russianfood.com В основе блюда — каша, в которую добавляют другие ингредиенты, например творог, сметану, яйца, сливочное масло. www.russianfood.com

Запеканка — более широкое понятие, в качестве наполнителя в ней может быть что угодно: от макарон до мяса. www.bolshoyvopros.ru

Таким образом, основное отличие в том, что крупеник базируется на крупе, а в запеканке «наполнителем» может быть любой продукт. При этом и крупеник, и запеканку обычно запекают в духовке. www.bolshoyvopros.ru