Кедр растёт в следующих экорегионах и природных заповедниках Алтая:

• Алтайский биосферный заповедник. 1 В Прителецкой части заповедника кедр встречается повсеместно на высоте от 435 метров (уровень Телецкого озера) до 1800–2000 метров над уровнем моря. 1
• Катунский биосферный заповедник. 24 Кедры растут на склонах гор, окаймляющих озеро Верхнее Мультинское, до высоты около 2500 метров над уровнем моря. 4

Также участки нетронутых кедровых лесов сохранились в Чинетинском заказнике в Краснощёковском районе Алтайского края, в верхнем течении реки Иня, на Тигирёкском хребте Западного Алтая. 2