Основные отличия географического расположения Сан-Франциско от других городов на западном побережье США:

• Город находится в северной части одноимённого полуострова. 13 С трёх сторон он омывается водами Тихого океана, залива Сан-Франциско и пролива Золотые Ворота. 3
• Материковая часть города по форме близка к квадрату. 1 Кроме того, частью Сан-Франциско являются небольшие острова Алькатрас, Треже, Йерба-Буэна и некоторые другие. 1
• Сан-Франциско находится в зоне повышенной сейсмической активности. 1 Рядом с ним проходят разломы Сан-Андреас (вдоль полуострова Сан-Франциско) и Хейворд (на восточной стороне залива). 1
• Для территории Сан-Франциско характерен сложный рельеф. 1 В нём насчитывают около пятидесяти возвышенностей, самая высокая из которых — Маунт-Дэвидсон (283 метра над уровнем моря). 1