Заповедник «Чёрные земли» имеет международное значение для сохранения биоразнообразия по следующим причинам:

• Статус «Биосферного резервата мирового значения». 12 Его присвоили в 1993 году решением Президиума Международного координационного Совета программы ЮНЕСКО «Человек и биосфера». 1
• Важнейшее местообитание водоплавающих птиц. 2 В 1994 году территория орнитологического участка заповедника в соответствии с Рамсарской конвенцией была включена в Российский список 35 водно-болотных угодий, имеющих международное значение в качестве важнейших местообитаний водоплавающих птиц. 2
• Сохранение популяции сайгака. 4 Заповедник ведёт постоянный мониторинг состояния популяции сайгака в Северо-Западном Прикаспии и обеспечивает её охрану. 1