Торатау считается уникальным природным объектом по нескольким причинам:

• Геологическое значение. 1 Гора представляет собой купол с обрывистыми склонами, сложенный известняками, которые содержат информацию о жизни древнего моря. 1 Известняки богаты окаменелостями различных представителей древних организмов: брахиопод, водорослей, губок, иглокожих, кораллов и других. 1
• Форма и отсутствие скальных выступов. 1 Конусная форма Торатау с наклоном склонов 20–30 градусов подчёркивает её геологическую уникальность. 1
• Уникальная флора и фауна. 15 Уникальные геологические и климатические условия горы создали особую экосистему, где сохранились реликтовые виды. 1 На Торатау произрастает 21 эндемичный вид растений, многие из которых включены в Красные книги Башкортостана и России. 1
• Историко-культурное значение. 5 Для башкир Торатау и земля вокруг неё считаются священными: именно здесь в древности проводились обряды. 5

Торатау с 1960 года признана археологическим памятником государственного значения, а с 1965 года — уникальным геологическим объектом. 15