Перец рекомендуется сажать в отдельные ёмкости по нескольким причинам:

• Предотвращение деформации стержневого корня. 2 У перца активно растёт стержневой корень, и если ему будет мало места в рассаде, он начнёт деформироваться, что влияет на урожай. 2
• Развитие корневой системы. 3 В небольшом пространстве корневая система закручивается в клубок и после пересадки на место долго не разрастается вглубь и вширь. 3
• Лёгкая пересадка на постоянное место. 3 Когда приходит время пересадки на постоянное место, растение в отдельной ёмкости имеет довольно большую и хорошо развитую корневую систему, а потому переносит пересадку легче. 3

При этом перец не следует сажать в слишком маленькие ёмкости: объём стакана должен быть как минимум 0,5 л, а ещё лучше 1 л. 3