Печора считается сложной для судоходства по нескольким причинам:

• Извилистость и мелководность. 1 Верхняя Печора очень извилиста и порожиста, что затрудняет навигацию. 1
• Сложность ледового и водного режимов. 1 Лёд задерживается на излучинах, в узостях русла и возле островов. 1
• Подпоры воды. 1 Высокие весенние уровни воды в Средней Печоре вызывают подпоры на устьевых участках её притоков. 1
• Непредсказуемое течение. 35 До эпохи парового судоходства течение реки было опасным для кораблей, их регулярно выбрасывало на прибрежные скалы. 5
• Изменение уровня воды. 2 В период низких меженных уровней судоходство по Печоре затруднительно для судов с осадкой более 50 см. 2

Особенно сложным для судов считался участок Печоры от пристани Якша до устья Илыча: выше Илыча по течению река была очень мелководна, быстра и камениста. 1