Папоротник щитовник мужской считается редким растением из-за уязвимости его сообществ к воздействию человека. 12
Сообщества щитовника мужского плохо переносят вырубку лесов и любое вторжение человека в свою среду. 12 Кроме того, у каждого растения чувствительные корневища, которые легко повреждаются и трудно восстанавливаются. 12
Несмотря на широкое распространение, щитовник мужской внесён в региональные Красные книги России и Украины. 12 Например, он занесён в Красные книги Мурманской и Томской областей, а также Бурятии. 3