Некоторые системные файлы нельзя удалить в безопасном режиме, потому что на компьютере есть другая учётная запись администратора, которая заблокировала удаление этих файлов или папок, получив право управлять ими. 1

Также файл или папку, содержащую файл, нельзя удалить, если в настоящий момент файл открыт в программе. 2

Ещё одна возможная причина — защита файла программой TrustedInstaller, в таком случае защищённые им файлы и папки трогать не рекомендуется, так как они понадобятся для стабильной работы системы. 2

Если речь идёт о системном файле, перед его удалением стоит подумать о целесообразности этого действия, так как часто оно может нести негативные последствия. 4