Ковыль перистый нуждается в охране и защите по нескольким причинам:

• Сокращение численности. 13 Освоение земель под сельскохозяйственные нужды привело этот вид на грань исчезновения. 1 Там, где раньше ковыль ковром покрывал степи, теперь лишь редкие островки растений. 1
• Влияние антропогенных факторов. 4 Чрезмерный выпас скота (особенно овец) и сбор для сухих букетов остей с зёрновками — одни из причин сокращения численности ковыля. 4
• Зарастание участков кустарниками и лесом. 2 Ковыль может исчезать при олуговении участков после прекращения выпаса. 2
• Малые площади территорий, подходящих для поселения ковылей. 3

Ковыль перистый внесён в Красную книгу Российской Федерации и взят под охрану в ряде регионов РФ. 4 Для сохранения вида необходимо регулировать выпас в местах его произрастания. 4