Ионическое море считается одним из самых чистых морей в Средиземноморье, вероятно, из-за особенностей его гидрологии: в море впадают только небольшие реки, что минимально влияет на разбавление морской воды. 2

Также Ионическое море напрямую связано с более солёными водами Средиземного моря и частично — с Адриатическим, что поддерживает высокий уровень соли. 2 Интенсивное испарение в жаркие летние месяцы дополнительно увеличивает концентрацию соли в воде. 2

На чистоту морской воды также влияет отсутствие промышленных зон недалеко от береговой линии и замкнутость моря (чем меньше рек впадает в море, тем морская вода чище). 5