Баргузинский заповедник имеет важное значение для сохранения биоразнообразия. 13 Он служит домом для множества видов животных, многие из которых являются редкими и находятся под угрозой исчезновения. 1 Например, амурский тигр, бурый медведь, сибирский олень, сибирская косуля и амурский леопард. 1

Также заповедник предоставляет базу для научных исследований в области экологии и охраны природы. 3 Учёные со всего мира приезжают сюда, чтобы изучать уникальные экосистемы и виды, а также проводить эксперименты по охране окружающей среды. 1 Благодаря этим исследованиям получаются ценные знания о том, как сохранить природу для будущих поколений. 1

Кроме того, на территории заповедника выявлены почти все виды растений Северо-Восточного Прибайкалья, занесённых в Красную книгу Бурятии. 2