Природные ресурсы Богородского городского округа включают огнеупорные белые глины, толстофарфоровое сырьё и строительные глины на крупнейшем в Московской области «Кудиновском» месторождении под городом Электроугли с запасами около 3 млрд тонн. 15 Также на территории округа добываются доломиты (Буньково), песчано-гравийный материал (Балобаново), пески стекольные (Старая Купавна). 15

Гидрография Богородского городского округа включает следующие особенности:

• Основные реки: Клязьма и её притоки Воря, Шерна, верховья Вохны (с притоком Ходца). 15
• Мелкие притоки Клязьмы: Шаловка, Лавровка, Черноголовка, Загрёбка, Плотня. 15
• Приток Шерны: Дубёнка. 15
• Притоки Вори: Жмучка и Пружёнка. 15
• Истоки речек бассейна Москва-реки: Донинки и Вьюнки. 15
• Озёра: Бисерово (крупнейшее озеро городского округа), Луково (самое глубокое озеро городского округа), Боровое (наиболее чистое озеро городского округа), а также озёра Ковёрши, Рабиновское и Шишовское. 15
• Водохранилища и пруды: Бисеровское водохранилище, Черноголовский, Купавинский, Боровковский, Ивановский, Пашуковский и Колонтаевский пруды. 15 Есть несколько водоёмов на месте бывших карьеров: Аборинский и Успенский — сообщающиеся с Клязьмой, «Шоколадка». 15