Некоторые основные источники поступления марганца в природные воды:

• Выщелачивание железомарганцевых руд и других минералов, содержащих марганец (пиролюзит, псиломелан, браунит, манганит, чёрная охра). 12
• Разложение водных животных и растительных организмов. 12 Особенно много марганца поступает в воду при разложении сине-зелёных, диатомовых водорослей и высших водных растений. 12
• Сточные воды марганцевых обогатительных фабрик, металлургических заводов, предприятий химической промышленности. 12
• Шахтные воды. 1

Также не исключена техногенная составляющая поступления марганца в поверхностные воды. 4