Индигирка используется в хозяйственной деятельности человека следующим образом:

• Транспорт. 24 Река является единственной транспортной магистралью в регионе. 2 По ней осуществляются грузоперевозки между посёлками, в том числе по зимнику. 2
• Рыболовство. 24 Индигирка богата рыбой, в её устье ведётся промысел ряпушки, чира, муксуна, нельмы, омуля, сига. 15
• Добыча золота. 15 В бассейне Индигирки ведётся золотодобыча. 25
• Развитие сельского хозяйства. 4 Благодаря своим плодородным берегам, река обеспечивает водой для полива полей и пастбищ для скота. 4