Географические координаты озера Чад (13° с. ш. и 14° в. д.) влияют на климат и флору следующим образом: озеро расположено в регионе с засушливым климатом, осадки обеспечивают менее 1/5 от общего объёма поступающей в озеро воды. 1 Это приводит к тому, что площадь озера и уровень воды в нём сильно меняются из года в год и зависят от притока воды из питающих озеро рек. 1

Флора вокруг озера также отличается: берега озера пологие, во многих местах заболоченные, на северной стороне обрамлены песчаными дюнами, к северо-востоку местность имеет характер степи, и лишь южный берег отличается богатой тропической растительностью. 1

Кроме того, через озеро Чад проходят границы нескольких климатических зон: на севере располагается Сахара, а с южной стороны к водоёму примыкают суданские травянистые саванны. 2