Черноморские мидии могут положительно влиять на экологическое состояние водоёмов, выполняя функцию естественных биофильтров. 4

Некоторые аспекты такого влияния:

• Фильтрация воды. 45 Мидии пропускают через себя большие объёмы морской воды, задерживая пищевые частицы. 2 Одна крупная мидия (размером более 5 см) фильтрует в сутки от 40 до 50 л морской воды. 5
• Преобразование загрязнителей. 2 Мидии способны воспринимать высокие концентрации нефтяных углеводородов, пропуская загрязнители через свой организм, они их преобразуют и очищают воду. 2
• Контроль численности фитопланктона. 4 Мидии контролируют численность фитопланктона, поглощающего биогены и загрязняющие вещества. 4
• Биоиндикация. 34 Мидии накапливают в своём организме загрязняющие вещества, содержащиеся в воде, и могут служить индикаторами загрязнённости экосистемы прибрежной зоны. 3

Однако есть и негативное влияние мидий на экологическое состояние водоёмов: например, в Великих озёрах США мидии, проникшие туда из Чёрного моря, создают благоприятную питательную среду для цианобактерий (синезелёных водорослей), выделяя фосфор. 1 Питаясь этим фосфором, водоросли обильно цветут и размножаются, но для водоёма и обитающей в нём живности это может быть вредно, так как отмирая, водоросли выделяют губительные токсины. 1