Заповедники и национальные парки Западной Сибири уникальны по разным причинам, например:

• Васюганский заповедник создан для охраны массива Васюганских болот, которые подвергаются периодическим падениям ступеней ракет, запускаемых из Байконура. 2
• Заповедник «Малая Сосьва» расположен в Ханты-Мансийском округе, где из-за сурового климата животный мир не очень богат, но природа подвергается загрязнению за счёт нефтедобычи. 2
• Юганский заповедник находится в ХМАО, здесь охраняется природа средней тайги. 2
• Гыданский заповедник занимает северные оконечности Гыданского полуострова, занятые тундрами, здесь распространена сплошная мерзлота. 2
• Национальный парк «Припышминские Боры» создан с целью сохранения уникального природного комплекса сосновых и берёзовых лесов. 1 Большую часть территории занимают лесные земли (около 90% площади). 1
• Шорский национальный парк создан для охраны участков и экосистем горной Шории, а именно кедровых лесов и черневой тайги. 1 Здесь расположено множество удивительных памятников природы, например, карстовые пещеры в бассейне реки Мрассу. 1

Кроме того, в некоторых из этих территорий сохранились уникальные виды флоры и фауны, которые занесены в Красные книги. 15 Например, в Шорском парке 60 из 510 растений внесены в Красную книгу, среди них — сибирский кандык, венерин башмачок, родиола розовая. 1