Машинист и машинистка — разные профессии, которые отличаются по роду деятельности. 1
Машинист — человек, который управляет машинами с высокой мощностью, например, машинист бетонного крана или локомотива. 1 Пол специалиста не имеет значения: и женщина, и мужчина могут быть машинистами. 1
Машинистка — женщина, выполняющая машинописные работы, в том числе на компьютере или пишущей машинке. 15 Если представителем этой профессии является мужчина, то слово «машинист» для него не подойдёт, нужно использовать другое название, например, «специалист по машинописным работам». 1
Таким образом, основное отличие в том, что машинист — более широкая профессия, а машинистка — конкретная специализация с указанием на пол специалиста.