Комплексные заказники отличаются от других видов охраняемых территорий тем, что их задача — сохранение и восстановление природных комплексов и ландшафтов. 17
В то время как в других видах заказников, например биологических, палеонтологических, гидрологических или геологических, охраняются отдельные ценные природные ресурсы (редкие виды растений и животных, ископаемые объекты, ценные водные объекты и экологические системы, ценные объекты и комплексы неживой природы) 126.
Также комплексные заказники имеют особое значение для познавательного туризма: в них туристов знакомят с редкими видами животного и растительного мира, живописными пейзажами. 14 Как правило, разбивка туристических стоянок на территории заказников запрещена, разрешается лишь прокладка туристских троп. 14