Отличие региональных и муниципальных автомобильных кодов заключается в их назначении:

• Региональные автомобильные коды указывают на принадлежность транспортного средства к определённому субъекту РФ. 49 Значения распределяются в алфавитном порядке, большая часть регионов сгруппирована по форме территориального устройства — республика, край, область, автономный округ. 1 У густонаселённых регионов обычно несколько автомобильных кодов. 1
• Муниципальные автомобильные коды (номера для муниципальных автобусов, такси и маршруток) имеют жёлтый фон, две буквы, при этом код региона тот же, что и для обычных автомобилей. 35

Таким образом, региональные коды обозначают географическую принадлежность автомобиля, а муниципальные — специфику муниципального транспорта (автобусов, такси и маршрутных такси).