Разница между защищённым режимом в Яндекс Браузере и режимом инкогнито заключается в их назначении и особенностях:

1. Защищённый режим предназначен для совершения более безопасных платежей и передачи конфиденциальных данных от пользовательского компьютера к серверу сайта. 5 Он включается на страницах банков и платёжных систем и обеспечивает строгую проверку сертификатов. 35 Если с сертификатом всё в порядке, Браузер отключает расширения и изменяет интерфейс. 3
2. Режим инкогнито создан для анонимности. 2 Он не даёт отслеживать местоположение и не записывает историю и временные файлы, введённые пароли. 2 При этом изменения настроек, загруженные файлы и сделанные закладки сохраняются. 6