Операционная система PS3 хранится не на жёстком диске, а во внутренней флэш-памяти. 1 Таким образом, переключение жёсткого диска ничего не изменит с операционной системой. 1 На жёстком диске хранятся только медиафайлы, сохранённые игры, DLC и т. д.. 1

Однако в моделях с eMMC, если установить жёсткий диск, консоль перенесёт все пользовательские данные с памяти eMMC на новый жёсткий диск. 2 В этом случае пользователь может полностью использовать жёсткий диск, хотя пустое место в eMMC теперь остаётся незанятым. 2

Перед использованием нового диска система PlayStation 3 переформатирует его под свой кастомный модифицированный линуксо-подобный формат и зашифрует его ключом. 5 После операции форматирования все данные на диске будут безвозвратно удалены. 5