Принцип работы файловой системы CD-ROM заключается в следующем:

1. Инициирующая дорожка данных на компакт-диске начинается со служебной области, необходимой для синхронизации между приводом и диском. 3
2. Далее расположена системная область, которая содержит сведения о структурировании диска. 3 В ней также находятся директории данного тома с указателями или адресами других областей диска. 3
3. Системная область содержит прямой адрес файлов в поддиректориях, что облегчает их поиск. 3

Стандартную файловую систему для CD-ROM определяет стандарт ISO 9660. 4 Он первого уровня напоминает файловую систему MS-DOS: имена файлов могут содержать до восьми символов, расширение имени файла (состоящее из трёх символов) отделяется от имени файла точкой. 3

Если файловая структура охватывает более одного сеанса, то ссылки из корневого каталога последующих сеансов включают в себя ссылки на каталоги предыдущих сеансов, и таким образом каталоги предшествующих сеансов становятся доступными в последующих сеансах. 3