В чем заключается основное отличие бизнес-хакатона от IT-хакатона?

Возможно, имелись в виду различия между хакатонами, которые проводятся в сфере бизнеса и в сфере IT.

Основное отличие заключается в тематике мероприятий:

• Бизнес-хакатоны направлены на создание новых бизнес-моделей, сервисов и стартапов. sky.pro Обычно на таких хакатонах заказчик объясняет бизнес-проблему и предлагает её решить. education.yandex.ru
• IT-хакатоны связаны с разработкой новых цифровых продуктов: сайтов, приложений, алгоритмов, чат-ботов. sky.pro В таких мероприятиях обычно участвуют разработчики, дизайнеры, маркетологи, нередко — специалисты по машинному обучению. education.yandex.ru

Таким образом, сфера деятельности хакатонов разная: в одних участники занимаются решением бизнес-проблем, в других — разработкой технологических решений.