Инновационный подход Applied Energistics к хранению и транспортировке предметов заключается в использовании ячеек хранения. 15 Они бывают четырёх разных размеров: 1 КБ, 4 КБ, 16 КБ и 64 КБ байт памяти. 5 Независимо от размера, каждая ячейка хранения может содержать только 63 уникальных предмета. 5

Для транспортировки используются туннели точка-точка (P2P). 3 Они позволяют перемещать каналы, энергию, жидкости, предметы, сигнал красного камня и даже свет от точки к точке. 3 При настройке туннелей обязательно должен быть 1 вход и как минимум 1 выход. 2

Также в модификации есть шина импорта, которая перемещает предметы в МЭ сеть из других механизмов или хранилищ, и шина экспорта, которая позволяет перемещать предметы из МЭ сети в другие механизмы или хранилища. 2