Разница между утилитами timedatectl и ntpstat для мониторинга времени заключается в их назначении:

1. timedatectl — это командная утилита, которая предоставляет удобный интерфейс для управления временем. 1 Она позволяет проверять текущие настройки времени и временной зоны, устанавливать системное и аппаратное время, настраивать временные зоны, включать и отключать синхронизацию времени с помощью NTP (Network Time Protocol). 1
2. ntpstat — это утилита, которая сообщает о состоянии синхронизации демона NTP (ntpd), работающего на локальной машине. 5 Она даёт информацию о том, синхронизирован ли сервер, и если да, то насколько точно. 2

Таким образом, timedatectl ориентирована на общее управление временем и настройками операционной системы, а ntpstat — на мониторинг состояния синхронизации через NTP.