Разница между Vanilla GNOME и Ubuntu GNOME заключается в том, что Ubuntu GNOME — это официальный вариант Ubuntu, а Vanilla GNOME — нет. 1 Ubuntu GNOME — это форк проекта GNOME, который предназначен для интеграции с операционной системой Ubuntu. 1

Некоторые другие различия:

• в Vanilla GNOME нет бокового дока или панели, как в Ubuntu GNOME; 1
• в Ubuntu GNOME есть такие дополнения, как Firefox вместо веб-браузера GNOME, Remmina вместо клиента удалённого рабочего стола GNOME Connections, расширение AppIndicators для иконок в правом верхнем углу некоторых приложений, расширение Ubuntu Dock для левой боковой панели для запуска приложений и другие; 4
• в Vanilla GNOME по умолчанию используется шрифт Cantarell, а в Ubuntu GNOME — Ubuntu. 2

Выбор между этими версиями зависит от личных предпочтений пользователя.